羅氏454推出emPCR自動化富集新方案

近，新的羅氏454測序emPCR自動化富集方案出臺：利用羅氏的REM e移液系統(tǒng)，一次實(shí)驗(yàn)可以處理多達(dá)八個樣本的乳液PCR產(chǎn)物磁珠法富集，并完成測序引物退火，直接銜接在羅氏454 GS FLX進(jìn)行測序?qū)嶒?yàn)。這一方法可一步完成了多個富集步驟，減少人為操作引起的誤差，使得實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定，并大大縮短實(shí)驗(yàn)時間。該方案已成功地在Hamilton MICROLAB STARlet自動化移液平臺上實(shí)現(xiàn)。

454測序需要對制備的文庫進(jìn)行乳液PCR，對包含單克隆序列的測序珠進(jìn)行擴(kuò)增，其后需要分解該乳液體系，并對體系中的測序珠進(jìn)行洗滌以及富集。在洗滌及富集過程中，需要進(jìn)行反復(fù)的移液、離心、顛倒試管、磁力吸附等操作。

這一自動化解決方案即替代了這一人工操作過程，只需少量的設(shè)置程序以及放置試管試劑的步驟就可以在無人情況下完成所有步驟，節(jié)省約五個小時左右的人工操作。單次自動化實(shí)驗(yàn)也只需3.5小時左右。

現(xiàn)在一共有五種不同的自動化實(shí)驗(yàn)設(shè)計，配合不同的樣本數(shù)量及體積。

在Hamilton STARlet自動化移液臺上，可以準(zhǔn)確設(shè)定羅氏REM e系統(tǒng)位置，以及其配套試管架的位置。實(shí)驗(yàn)所需放置的試管及試劑的種類和數(shù)量也在新的實(shí)驗(yàn)手冊中進(jìn)行了詳細(xì)描述。

羅氏的REM e系統(tǒng)可以進(jìn)行震蕩、真空抽濾、磁珠捕獲及加熱等實(shí)驗(yàn)操作。Hamilton STARlet移液平臺通過1000微升的獨(dú)立移液系統(tǒng)移動液體。

羅氏的REM e系統(tǒng)也可以裝載在其他移液平臺上如Biomek及Tecan系列平臺等。

羅氏454公司將進(jìn)一步與該自動化移液平臺公司合作開發(fā)配合GS Junior系統(tǒng)的自動化解決方案， 可在Hamilton的STAR系列及NIMBUS系列自動化移液平臺上實(shí)現(xiàn)。小型的NIMBUS工作站與GS Junior臺式測序儀結(jié)合，使得測序總量較小的客戶能夠獲得完整而低資金投入的自動化解決方案。